黟县交通局设置三个职能股室（办公室、运管股、公建股）。
　　（一）办公室
　　协助局领导组织管理机关日常工作，制定局机关各项工作制度，起草有关文件和报告，负责会议组织、文电处理、档案、信访、保密、信息及机关行政事务管理工作；负责计划生育工作；组织办理人大议案、政协提案和人民建议工作；负责局机关财务工作和局机关后勤保障及行政管理工作；负责办理局党组日常工作；协助领导指导全县交通系统思想政治工作；负责局机关机构、编制、人事制度改革和管理工作；负责劳动工资管理和社会保险工作；负责交通系统职工教育、专业技术职务评聘、技工等级考核及智力引进工作；负责精神文明建设和文明行业创建工作；负责老干部工作及机关离退休人员管理服务工作；指导协调局直属单位社会治安综合治理、安全保卫及普法工作；负责交通行政执法、执法监督、行政复议、行政诉讼工作。
　　（二）交通运输管理股
　　组织全县公路客货运输市场调查，负责全县公路运输市场的培育和管理，维护全县公路运输行业平等竞争秩序；组织协调重点物资运输，春节、五一节、十一节运输及防汛、抗旱、抢险救灾、军事行动等紧急运输任务的完成；负责汽车出入境运输的管理工作；负责出租车行业管理工作；负责全县汽车维修市场、驾驶员培训和营业性客货运输站（场）等行业管理工作；负责运输质量管理、节能等工作；指导危险品运输安全管理工作；负责监督、检查交通经济政策和行业法规的实施；指导交通行业经济体制改革、结构调整工作；负责编制全县交通行业发展规划、年度计划；负责固定资产投资项目的立项审查；负责交通行业综合统计、经济和科技信息工作；指导监督全县交通系统贯彻执行财务会计规章制度；指导督促各项交通规费的征收；负责直属单位财务管理和国有资产管理工作；负责交通系统财政、税收、信贷、引资等协调工作；负责内部审计工作。
　　（三）交通建设管理股（挂县交通战备办公室）
　　负责交通建设综合工作，参与编制交通行业发展规划、中长期计划和年度计划；负责权限内的基建项目的设计文件审查、监督协调项目实施；按照国家和省有关法律法规，推行交通基础设施建设项目法人负责制、招标投标制、建设监理制、合同管理制；负责工程质量管理和工程定额管理；负责编制全县县乡道路发展规划、年度计划；负责县乡道路的建设、养护和管理工作；负责全县县道路路政管理工作；负责交通基础设施建设市场的管理及环保、绿化工作。